辯經為西藏三大寺佛學的最大特色，辯經者由較優秀僧人擔任，其方式各寺不同，主要可分為對辯和立宗辯兩種形式。

辯經指的指按照因明學體系的邏輯推理方式，辯論佛教教義的學習課程。藏語稱“村尼作巴”，意為“法相”，是藏傳佛教喇嘛攻讀顯宗經典的必經方式。多在寺院內空曠之地、樹陰下進行。最早源于赤松德贊時期大乘和尚和噶瑪拉錫拉的公開辯論。辯經這種方式最早源自古印度。公元792年，赤松德贊從印度請來蓮花生、寂護（就是建桑耶寺的那兩個人）等高僧，入藏宏法。當時在西藏也有不少漢僧，領頭的叫大乘和尚。